Another Dayu

开源我的个人基因分析流程

去年做完 WeGene 的全基因组测序之后,就一直想自己分析试试,于是有了这个项目。

整个项目是和 Claude 一起完成的,把分析流程整理成了 Skills 的形式,并开源到了 GitHub:https://github.com/DayuGuo/genome-atlas-skill

WeGene 测序数据分两种,过滤过的基因型数据表(15 MB左右)和 FASTQ/BAM/CRAM 等格式的原始测序文件(30-90 GB)。所以我制作了两个版本的 Skill,一个适合普通爱好者尝试,普通笔记本电脑也能分析;另一个则适合有专业分析设备的朋友尝试,可能需要半天的时间。

基础版的结果和 WeGene 官方报告差异不大,自己把数据从头到尾跑一遍,还是挺有趣的,并且能改用自己喜欢的可视化方案。完整版的数据更全,可自定义的部分也更多,有许多探索的空间。

示例报告:

示例图:

界面风格参考了 lieflat-charts